韓国での新型コロナウイルス遺伝子分析結果
韓国疾病管理庁 11月14日発表 ブリーフィング資料より
□ 中央防疫対策本部は、国内コロナ19の患者検体1,301件*（1月20日〜10月28日）で検出したウイルスの遺伝子の塩基配列の追加分析結果を発表した。
* 1月20日以降の累積：1,301件（国内発生1,041件、海外流入260件）
〇 コロナ19ウイルスは、世界的に4月初めまでSとV型が流行している。その後G、GR、GH型が流行中で、北米はGH型、南米、オセアニア、アフリカ、ロシアはGR型が優勢な状況である。
〇 国内のウイルスの遺伝子分析の結果、4月まではS、V型が多数確認されたが、5月以降、最近までGH型に属するウイルスが主に検出されており、10月中に分析されたウイルスの42件すべてGH型で国内優勢型と確認された。
〇 最近WHOの国際インフルエンザ情報共有機構（Global Initiative for Sharing All Influenza Data、GISAID）は元の分類体系であるG型内のいくつかのタイプをGV型*という名称で再分類し、それに応じて韓国も遺伝子型を再分析した結果、全1,301件のうち2件がGV型に分類さ**された。
* G型内のスパイクタンパク質222番目のアミノ酸に変異が存在
**京畿道龍仁市大地/竹田高校2次集団発生事例（9月30日から10月15日まで学生7人と家族5人発生）で2件が確認されており疫学的関係と遺伝子分析などを追加調査中
〇 今回の分類体系の変更は、非重要部位の遺伝子とアミノ酸の置換によるものであり、WHOはこれと関連して抗体反応と病原性の関連性は低いと予測している。
□ 海外流入コロナ19確診者由来のウイルス分類
分類体系 | 分析件数 | 大陸名 | 国家名 |
S 型 | 26 | アジア | 中国(14), ウズベキスタン(9), タイ(1) |
アメリカ | 米国(2) | ||
V 型 | 7 | アジア | 中国(1) |
ヨーロッパ | 英国(5), オランダ(1) | ||
L 型 | 4 | アジア | シンガポール(1), 日本(3) |
G 型 | 19 | アジア | フィリピン(1), インドネシア(1) |
アメリカ | メキシコ(3), 米国(2) | ||
アフリカ | アルジェリア(1) | ||
ヨーロッパ | 英国(2), オランダ(2), フランス(1), スペイン(1), ロシア(1), その他(3) | ||
中東 | アラブ首長国連邦(1) | ||
GH 型 | 68 | アジア | バングラディシュ(3), ウズベキスタン(1), インドネシア(4), カザフスタン(2), キルギスタン(1), パキスタン(3), フィリピン(1), インド(2) |
アメリカ | メキシコ(1), 米国(19), カナダ(1) | ||
ヨーロッパ | 英国(2), オランダ(1), フランス(3), ドイツ(1), その他(2) | ||
中東 | イラク(19), クウェート(2) | ||
GR 型 | 132 | アジア | バングラディシュ(4), ウズベキスタン(14), インド(2), 日本(6), カザフスタン(27), キルギスタン(4), タジキスタン(1), パキスタン(5), フィリピン(13), アフガニスタン(1), ネパール(2), その他(2) |
アメリカ | メキシコ(3), 米国(2), ブラジル(1), カナダ(1) | ||
ヨーロッパ | 英国(6), ロシア(21), オランダ(2), フランス(2), ドイツ(1), スペイン(1), べラルーシ(1) | ||
中東 | アラブ首長国連邦(4), クウェート(1), イラク(1) | ||
その他の型 | 4 | アジア | パキスタン(1), フィリピン(2) |
中東 | クウェート(1) | ||
計 | 260 |
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□ コロナ19ウイルス 型 月別推移
| 1月 | 2月 | 3月 | 4月 | 5月 | 6月 | 7月 | 8月 | 9月 | 10月 | 合計 | |
S | 7 | 13 | 12 |
| 2 |
| 9 |
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| 43 | (3.3%) |
V | 2 | 78 | 41 | 3 |
|
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| 124 | (9.5%) |
G |
|
| 7 | 3 | 2 | 1 | 6 |
| 2 |
| 21 | (1.6%) |
GH |
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| 15 | 12 | 175 | 233 | 103 | 264 | 102 | 43 | 947 | (72.8%) |
GR |
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| 13 | 5 | 11 | 31 | 65 | 19 | 8 | 3 | 155 | (11.9%) |
GV |
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| 2 |
| 2 | (0.2%) |
その他 |
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| 1 |
| 3 | 1 |
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| 5 | (0.4%) |
L | 1 | 3 |
|
|
|
|
|
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| 4 | (0.3%) |
合計 | 10 | 94 | 89 | 23 | 193 | 266 | 183 | 283 | 114 | 46 | 1,301 | |
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□ 国内地域内感染コロナ19 ウイルス型月別推移
| 1月 | 2月 | 3月 | 4月 | 5月 | 6月 | 7月 | 8月 | 9月 | 10月 | 合計 | |
S | 2 | 4 | 11 |
|
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| 17 | (1.6%) |
V | 1 | 78 | 35 | 3 | 1 |
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| 118 | (11.3%) |
G |
|
|
|
|
|
| 2 |
|
|
| 2 | (0.2%) |
GH |
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| 6 | 169 | 224 | 83 | 260 | 95 | 42 | 879 | (84.4%) |
GR |
|
|
|
|
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| 5 | 18 |
|
| 23 | (2.2%) |
GV |
|
|
|
|
|
|
|
| 2 |
| 2 | (0.2%) |
その他 |
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|
|
| 0 | (0.0%) |
L |
|
|
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|
|
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|
|
| 0 | (0.0%) |
合計 | 3 | 82 | 46 | 9 | 170 | 224 | 90 | 278 | 97 | 42 | 1,041 | |
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□ 海外流入コロナ19ウイルス型月別推移
| 1月 | 2月 | 3月 | 4月 | 5月 | 6月 | 7月 | 8月 | 9月 | 10月 | 合計 | |
S | 5 | 9 | 1 |
| 2 |
| 9 |
|
|
| 26 | (10.0%) |
V | 1 |
| 6 |
|
|
|
|
|
|
| 7 | (2.7%) |
G |
|
| 7 | 3 | 2 | 1 | 4 |
| 2 |
| 19 | (7.3%) |
GH |
|
| 15 | 6 | 6 | 9 | 20 | 4 | 7 | 1 | 68 | (26.2%) |
GR |
|
| 13 | 5 | 11 | 31 | 60 | 1 | 8 | 3 | 132 | (50.8%) |
GV |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 0 | (0.0%) |
その他 |
|
| 1 |
| 2 | 1 |
|
|
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| 4 | (1.5%) |
L | 1 | 3 |
|
|
|
|
|
|
|
| 4 | (1.5%) |
合計 | 7 | 12 | 43 | 14 | 23 | 42 | 93 | 5 | 17 | 4 | 260 | |
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添付 9 |
| コロナ19新規分類型（GV）の現状 |
□ 新規分類型(GV) 追加(WHO,‘20.10.30)
〇 WHO GISAID 新規分類 GV 型追加
- 基分類体系である G型内 S タンパク質 222番目アミノ酸に変異確認
*アラニン（Alanine）からバリン（Valine）に変異（A222V）したウイルスは、ヨーロッパ青年層を中心に7、8月以降増加し、新規型（GV）を追加
* 11月11日 基準として登録された全遺伝体のうち11.5％（22,475件/196,069件）を占める
- GV 型に対する WHO の評価 ① 抗体反応及び ② 病原性との関連性は低いものと予測
連番 | 分類体系 | 分類対象遺伝子 | 分類対象アミノ酸 | |
1 | S 型 | ORF8 | L84S | |
2 | V 型 | NS3 | G251V | |
3 | G 型 | G 型 | S | D614G |
4 | GH 型 | S | D614G | |
NS3 | Q57H | |||
5 | GR 型 | S | D614G | |
N | G204R | |||
6 | GV 型* | S | D614G | |
S | A222V | |||
7 | L 型 | WIV04分離株（武漢分離株）と遺伝的近縁性 | ||
8 | その他の型 | 6分類体系に含まれないウイルス | ||
□ 国内地域内感染コロナ19確診者由来のウイルス分類(未翻訳)
分類体系 | 分析件数 | 疫学情報 |
S 그룹 | 17 | 우한 교민, 구로콜센터 등 |
V 그룹 | 118 | ○ 수도권 - 분당제생병원, 성남은혜의강교회, 의정부성모병원 등 ○ 영남권 - 신천지 관련, 청도대남병원, 부산온천교회, 봉화푸른요양원 등 ○ 중부권 - 천안줌바댄스, 정부청사 |
G 그룹 | 2 | 수도권 미분류 |
GH 그룹 | 879 | ○ 강원권 - 홍천캠핑장, 원주실내체육시설, 강원도양양군/강릉시지인모임 등 ○ 수도권 - 이태원 클럽, 쿠팡물류센터, 리치웨이, 강남구커피숍, 고양시기쁨153교회, 고양시반석교회, 롯데리아종사자, 서울안디옥교회, 성북구사랑제일교회, 용인대지고/죽전고(8월 1차), 파주스타벅스, 815광화문집회, 성북구체대입시학원, 여의도순복음교회, 9월 재검출, 부천가족/유진전기, 서울아산병원, 중앙보훈병원, 쿠팡물류센터 강남구신도벤처타워, 강남구케이티원큐, 경기광주SRC재활병원, 경기군포의료기관/안양요양시설, 경기부천명절가족모임, 경기북부군부대, 경기양주섬유회사, 구로구신도림역사, 대우디오빌플러스, 도봉구운동시설, 동두천동네친구모임, 디와이디벨로먼트, 부평구지인모임, 사랑나무어린이집, 삼모스포렉스, 생명길교회, 서울관악삼모스포렉스2, 마포고, 서대문구장례식장, 송파잠언의료기기, 영등포구방문판매, 수도권어르신쉼터/지인모임, 안양음악학원, 양주군부대, 예마루데이케어센터, 이천노인주간보호센터 등 ○ 영남권 - 경북예천, 부산연제구일가족, 부산영진호, 울산현대중공업, 경북경주현수막나라, 경북포항세명기독병원, 부산그린코아목욕탕, 부산금정구평강의원, 부산동아대학교부민캠퍼스, 부산방문주사, 부산북구식당관련, 부산연제건강용품사업설명회, 부산해뜨락요양병원 등 ○ 중부권 - 대전꿈꾸는교회, 대전방문판매업체, 대전유성구일가족명절모임, 미분류, 충남천안지인모임 등 ○ 호남권 - 광주광륵사, 광주상무유흥시설, 정읍일가족, 미분류 등 ○ 제주권 - 제주탄방산탄산온천, 제주루프트탑정원게스트하우스 |
GR 그룹 | 23 | ○ 영남권 - 부산부경보건고, 부산기계공고 등 ○ 중부권 - 청주이슬람(우즈베키스탄)신도 |
GV 그룹 | 2 | ○ 수도권 - 용인대지고/죽전고(9-10월 2차) |
計 | 1,041 |
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